重なったシークエンスの波形を分離する
CRISPR-Cas9で遺伝子の破壊は容易にできるようになりました。シロイヌナズナの遺伝子を破壊する場合、形質転換をして最初に得られた種子(T1)世代では相同染色体のそれぞれに起きた変異が異なる状態(biallelic)になっているこ ...
中部大学祭の研究発表展に出演しました
2021年中部大学祭の研究発表展に応用生物化学科の紹介動画を作成しました。他の先生とともに出演したのでぜひご覧ください。私の出番は5分10秒過ぎからです。
注意: 研究発表となっていますが、当研究室では犬のゲノムは解析していませ ...Two structurally different oomycete MAMPs induce distinctive plant immune responses
Mohammad Shahjahan Monjil, Hiroaki Kato, Kentaro Matsuda, Natsumi Suzuki, Shiho Tenhiro, Maurizio Camagna, Takamasa S ...
写真のインデックスをつくる
たくさん撮った写真のサムネイルをHTMLで作ります。特定の画像管理ソフトを使わないので、自由にレイアウトして説明を加えることができます。
ImageMagickをインストールWindows Subsystem for Linux ...遺伝子の構造を描く
遺伝子のエキソン、イントロン構造をRを使って書く方法です。
TrinityでcDNAをアセンブル
TrinityはRNA-Seqのリードをアセンブルして、cDNAの配列をつくります。
リファレンスGrabherr MG, Haas BJ, Yassour M, Levin JZ, Thompson DA, Amit I ...
WordPressのカスタマイズ
WordPressのプラグインを検索するとありとあらゆるものがあります。それを自分のWordPressにいれて有効化すると様々な機能を追加することができます。
zipファイルをダウンロードするWORD P ...
Linuxを用意する
バイオインフォマティクスにしろデータサイエンスにしろ、Linuxを使えるようになることが必須です。
実機を用意するまずは古くなって使われなくパソコンを用意しましょう。あまり古いものだと十分な計算速度がでなくて役に立たないか ...
文献管理ソフト Zotero
Zoteroは無料で使える文献管理ソフトです。ブラウザーで見つけた論文をクリック一つでデータベースに入れることができ、それらを引用文献として活用することができます。特に便利なのがWORDへの引用の挿入と、自分の論文データベースを複数の ...
dockerを使う
dockerはコンピュータの仮想環境を提供します。ときに複数のアプリケーションソフトが互いに異なる環境を要求するようなことがあります。そういったときに、dockerを使うと別々の環境を与えることができます。
dockerのインス ...