Linux, docker Apache, WordPress Excel, Zotero make プログラム的なコードを書かない。繰り返しと条件分岐がない。コマンドの実行。

コンピュータ活用

次世代シーケンサーのデータは巨大で、データのコピーをするのも一苦労です。PoTHoSやMitsucalにはfastqファイルへのリンクをつけてありますが、一つずつクリックして保存するのは大変です。Linuxのツールを使って楽をしましょ ...

コンピュータ活用, データサイエンス

中部大学の教員は年度ごとに「研究等業績」を大学に報告します。発表論文をその書式に合わせて出力するのが面倒ということで、ツールの活用を考えます。
researchmapは研究者の情報を集めたサイトで、アカウントがあれば業績を記録 ...

コンピュータ活用, 研究の横道

apacheのUserDirの機能を使うとユーザーが自分のディレクトリをウェブで公開することができます。CentOS7でこの機能を有効にする手順を記します。

apacheの設定1. UserDir disabled をコメントア ...

コンピュータ活用

論文の図にいれる三角とか矢じり(arrowhead)とかを描きます。PhotoshopとかIllustratorよりも簡単にできます。

白地に右向き三角 $ convert -size 10x10 'xc:white' -dra ...

コンピュータ活用

たくさん撮った写真のサムネイルをHTMLで作ります。特定の画像管理ソフトを使わないので、自由にレイアウトして説明を加えることができます。

ImageMagickをインストールWindows Subsystem for Linux ...

コンピュータ活用

プラグインをいれる

WordPressのプラグインを検索するとありとあらゆるものがあります。それを自分のWordPressにいれて有効化すると様々な機能を追加することができます。

zipファイルをダウンロードする

WORD P ...

コンピュータ活用

バイオインフォマティクスにしろデータサイエンスにしろ、Linuxを使えるようになることが必須です。

実機を用意する

まずは古くなって使われなくパソコンを用意しましょう。あまり古いものだと十分な計算速度がでなくて役に立たないか ...

コンピュータ活用

Zoteroは無料で使える文献管理ソフトです。ブラウザーで見つけた論文をクリック一つでデータベースに入れることができ、それらを引用文献として活用することができます。特に便利なのがWORDへの引用の挿入と、自分の論文データベースを複数の ...

コンピュータ活用

dockerはコンピュータの仮想環境を提供します。ときに複数のアプリケーションソフトが互いに異なる環境を要求するようなことがあります。そういったときに、dockerを使うと別々の環境を与えることができます。

dockerのインス ...

コンピュータ活用

WordPressを使うことにしました。しかし、既存のCentOS7で動かそうとしたところ、WordPressの要件(PHP7やMySQL)を整えることができませんでした。そこでdockerで仮想環境を用意してやってみました。 ...