R, バイオインフォマティクス

遺伝子のエキソン、イントロン構造をRを使って書く方法です。

バイオインフォマティクス

TrinityはRNA-Seqのリードをアセンブルして、cDNAの配列をつくります。

リファレンス

Grabherr MG, Haas BJ, Yassour M, Levin JZ, Thompson DA, Amit I ...

コンピュータ活用

プラグインをいれる

WordPressのプラグインを検索するとありとあらゆるものがあります。それを自分のWordPressにいれて有効化すると様々な機能を追加することができます。

zipファイルをダウンロードする

WORD P ...

コンピュータ活用

バイオインフォマティクスにしろデータサイエンスにしろ、Linuxを使えるようになることが必須です。

実機を用意する

まずは古くなって使われなくパソコンを用意しましょう。あまり古いものだと十分な計算速度がでなくて役に立たないか ...

コンピュータ活用

Zoteroは無料で使える文献管理ソフトです。ブラウザーで見つけた論文をクリック一つでデータベースに入れることができ、それらを引用文献として活用することができます。特に便利なのがWORDへの引用の挿入と、自分の論文データベースを複数の ...

コンピュータ活用

dockerはコンピュータの仮想環境を提供します。ときに複数のアプリケーションソフトが互いに異なる環境を要求するようなことがあります。そういったときに、dockerを使うと別々の環境を与えることができます。

dockerのインス ...

プログラミング

/と/labo/suzuki で二つのWordPressを動かす。

dockerコンテナを用意する

Dockerを使ってWordPressの動くウェブサーバーを立ち上げるに従って、二組のコンテナを立ち上げる。
以後/ ...

R

新しい研究室のホームページのトップにいれる絵を考えて、研究室らしいということでシークエンスデータをいれてみようと考えました。
適当な実験データをもってこようかとしたのですが、思うようなものがなく、人工的につくってみることにしま ...

プログラミング

WordPressで業績リストを管理するためのプラグイン(MyBibliography)をつくる論文は個別に記事として投稿する。
業績一覧を表示したいページではショートコードとしてプラグインの機能を呼び出す。プラグインがWordPre ...

R

RでSVG形式の図を作ります。

# CRANから除かれていたので、ソースをダウンロード
$ curl -O

# Rを起動して、ソースからインストール
>instal