R,コンピュータ活用,データサイエンス,プログラミング

ShinyはRのコードでウェブアプリケーションをつくることを可能にします。

インストールdockerを活用します。# cat compose.yamlversion: '3.1'services: shiny: image: r ...

R,データサイエンス,研究の横道

Pikmin Bloomの新しいイベントで、フィンガーボードをつけたピクミンがでてくるものが始まりました。昨年4種類が登場していて、今回追加で3種類が増えました。一様にランダムにでてくるとして、全てをそろえるには何匹ひっこぬけばいいの ...

R,データサイエンス,プログラミング

次のようなデータがあって、同じ遺伝子(1列目)のデータを連結したい(横に並べたい)とします。

1つ目のデータlogCPMlogFCPValueFDRAT5G07990.16.502-0.9552.55E-139.32E-09AT ...

R,データサイエンス,研究の横道

Pikmin Bloomというゲームがあります。先日新年のイベントで、2023眼鏡をつけたピクミンがでてくるというものがありました。7種類のピクミンがいて、一様にランダムにでてくるとして、全てをそろえるには何匹ひっこぬけばいいのかをシ ...

R,コンピュータ活用,データサイエンス

私の3通りのRの使い方WindowsのRGui良いところ

グラフ(画像)がその場で表示される。

悪いところ

ヘルプがブラウザーで表示される(見るたびにタブが増えていく)。Linuxで解析したデータを読み込むのが面倒(SCPとか ...

R,バイオインフォマティクス

プロテオミクスのデータ(タブ区切りテキスト)をRで解析しようとしたところ、データの読み込みでつまづきました。その改善の足跡です。

とりあえずread.tableで読み込む> a <- read.table("ALL_ ...

R,バイオインフォマティクス

RNA-Seqで遺伝子発現の解析(mRNAの定量)をしたときに、サンプル間で比較をするために用いられる相対値(Fragments Per Kilobase of exon per Million mapped reads)を求めること ...

R,バイオインフォマティクス

遺伝子のエキソン、イントロン構造をRを使って書く方法です。

R

新しい研究室のホームページのトップにいれる絵を考えて、研究室らしいということでシークエンスデータをいれてみようと考えました。
適当な実験データをもってこようかとしたのですが、思うようなものがなく、人工的につくってみることにしま ...

R

RでSVG形式の図を作ります。

# CRANから除かれていたので、ソースをダウンロード
$ curl -O

# Rを起動して、ソースからインストール
>instal