データサイエンス, バイオインフォマティクス

Jupyter Notebook (以下Jupyter)でblastとかbowtieとかバイオインフォマティクスのツールを使えるようにします。

Jupyterのインストール

pip3 install jupyterとかana ...

PHP, プログラミング

小学校からの連絡が電子メールになり、配布物がPDFファイルになりました。PDFをダウンロードできるのが5日以内で、保存するのを忘れると面倒なことになりそうです。またファイル名が内容と無関係で、探すのが大変そうなので電子メールを自動的に ...

PHP, プログラミング

Zend_Applicationの一部としてではなく、単独で使用する方法です。単一のファイルで十分なちょっとしたプログラムで、HTMLをPHPから除きたいときに使えます。

index.php<?phprequire_onc ...

コンピュータ活用

論文の図にいれる三角とか矢じり(arrowhead)とかを描きます。PhotoshopとかIllustratorよりも簡単にできます。

白地に右向き三角 $ convert -size 10x10 'xc:white' -dra ...

バイオインフォマティクス, プログラミング, 研究

CRISPR-Cas9で遺伝子の破壊は容易にできるようになりました。シロイヌナズナの遺伝子を破壊する場合、形質転換をして最初に得られた種子(T1)世代では相同染色体のそれぞれに起きた変異が異なる状態(biallelic)になっているこ ...

コンピュータ活用

たくさん撮った写真のサムネイルをHTMLで作ります。特定の画像管理ソフトを使わないので、自由にレイアウトして説明を加えることができます。

ImageMagickをインストールWindows Subsystem for Linux ...

R, バイオインフォマティクス

遺伝子のエキソン、イントロン構造をRを使って書く方法です。

バイオインフォマティクス

TrinityはRNA-Seqのリードをアセンブルして、cDNAの配列をつくります。

リファレンス

Grabherr MG, Haas BJ, Yassour M, Levin JZ, Thompson DA, Amit I ...

コンピュータ活用

プラグインをいれる

WordPressのプラグインを検索するとありとあらゆるものがあります。それを自分のWordPressにいれて有効化すると様々な機能を追加することができます。

zipファイルをダウンロードする

WORD P ...

コンピュータ活用

バイオインフォマティクスにしろデータサイエンスにしろ、Linuxを使えるようになることが必須です。

実機を用意する

まずは古くなって使われなくパソコンを用意しましょう。あまり古いものだと十分な計算速度がでなくて役に立たないか ...