データサイエンス

プロテオミクスのデータ(タブ区切りテキスト)をRで解析しようとしたところ、データの読み込みでつまづきました。その改善の足跡です。

とりあえずread.tableで読み込む> a <- read.table("ALL_ ...

RNA-Seqで遺伝子発現の解析(mRNAの定量)をしたときに、サンプル間で比較をするために用いられる相対値(Fragments Per Kilobase of exon per Million mapped reads)を求めること ...

Javascriptでオセロをつくる 第1回
マス(td)に位置情報を加える

現在作成中のJavascriptオセロでは、盤面をtableで、石を置くマスをtdで表現しています。tdがクリックイベントを捉えて、石を置いたりひっく ...

オセロ盤と石をつくる

まずオセロ盤と石をHTMLとCSSでつくります。オセロ盤はtableで、石は角を丸めたdivでつくってみます。

othello1.htmlのソースothello1.htmlの実行結果

下に表示されないとき ...

Jupyter Notebook (以下Jupyter)でblastとかbowtieとかバイオインフォマティクスのツールを使えるようにします。

Jupyterのインストール

pip3 install jupyterとかana ...

小学校からの連絡が電子メールになり、配布物がPDFファイルになりました。PDFをダウンロードできるのが5日以内で、保存するのを忘れると面倒なことになりそうです。またファイル名が内容と無関係で、探すのが大変そうなので電子メールを自動的に ...

Zend_Applicationの一部としてではなく、単独で使用する方法です。単一のファイルで十分なちょっとしたプログラムで、HTMLをPHPから除きたいときに使えます。

index.php<?phprequire_onc ...

論文の図にいれる三角とか矢じり(arrowhead)とかを描きます。PhotoshopとかIllustratorよりも簡単にできます。

白地に右向き三角 $ convert -size 10x10 'xc:white' -dra ...

CRISPR-Cas9で遺伝子の破壊は容易にできるようになりました。シロイヌナズナの遺伝子を破壊する場合、形質転換をして最初に得られた種子(T1)世代では相同染色体のそれぞれに起きた変異が異なる状態(biallelic)になっているこ ...

たくさん撮った写真のサムネイルをHTMLで作ります。特定の画像管理ソフトを使わないので、自由にレイアウトして説明を加えることができます。

ImageMagickをインストールWindows Subsystem for Linux ...